Hay mas variantes.

Lo dicho por woxter2003 seria si son 2 discos y el segundo es mayor que el primero (sino tampoco vale la pena, claro) , pero si es un solo disco con 2 particiones mejor el partition magic.

Sabiendo que son programas ,datos, ... no habrai problemas.

Por ejemplo: peliculas, canciones, ... las puedes pasar al otro disco sin problemas. Yo prefiero mas de una particion para guardar copias de seguridad de la parte sensible, pero si no sabes tocar ni guardar pues lo de arriba seria la solucion, bien dar la vuelta a los discos, bien hacer una sola particion.

Aun asi vuelvo a insistir que yo dejaria las 2 particiones pero seguiria una politica mejor.