Te tiene que dar las mismas respuestas que en el manual, y como tu mismo puedes comprobar no es así.

Lo que te contesta a ti.

avrdude: Device signature = 0x0f0102
avrdude: Expected signature for ATMEGA88 is 1E 93 0A

Lo que tendría que contestar.

avrdude: Device signature = 0x1e930a
De hecho en los fuses si sale. Esto implica que luego salga el error.

avrdude: verifying ...

avrdude: verification error, first mismatch at byte 0x0000

Mientras salga eso es tontería programar los fuses a continuación, no vale de nada. Inténtalo con el avrdude-gui.
Yo instalaría el winavr directamente en C, y el bin, también puesto en C.

Saludos.